MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p3

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017141	CTTTCT	2	12	15	26	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017141	CAA	2	6	63	68	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017141	T	7	7	84	90	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017141	TCC	2	6	166	171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017141	CCT	2	6	182	187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017141	AAT	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017141	TAG	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017141	ATTT	2	8	285	292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017141	AG	3	6	297	302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017141	CATG	2	8	331	338	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017141	ATG	2	6	496	501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017141	TAA	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017141	TTA	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017141	TAA	2	6	587	592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017141	ACTT	2	8	636	643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017141	GA	3	6	670	675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017141	ATTTTT	2	12	700	711	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017141	AGA	2	6	742	747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017141	TCC	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017141	ACT	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017141	CAG	2	6	852	857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017141	CT	3	6	890	895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017141	ATT	2	6	1049	1054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017141	AGGA	2	8	1062	1069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017141	TGTT	2	8	1084	1091	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017141	A	6	6	1109	1114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017141	TAA	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017141	AATT	2	8	1648	1655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017141	A	8	8	1661	1668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017141	TATT	2	8	1711	1718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017141	AG	3	6	1722	1727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017141	AT	3	6	1742	1747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017141	AT	3	6	1753	1758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017141	ACA	2	6	1770	1775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017141	ATT	2	6	1791	1796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017141	ACA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017141	TA	3	6	1890	1895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017141	TAA	2	6	1900	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017141	TTTA	2	8	1908	1915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017141	AT	4	8	1951	1958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017141	AATG	2	8	1988	1995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017141	A	6	6	2477	2482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017141	A	8	8	2484	2491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017141	CCT	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017141	A	7	7	2910	2916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017141	CTTT	2	8	2927	2934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017141	TAAA	2	8	3279	3286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017141	CAT	2	6	3298	3303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017141	TCC	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017141	T	6	6	4876	4881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017141	AT	3	6	5279	5284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017141	ACT	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017141	AAT	2	6	5899	5904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017141	A	7	7	5987	5993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017141	TATAT	2	10	6028	6037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017141	T	6	6	6108	6113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017141	CCT	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.